干燥是古老的操作，但粉体和生物制品的加热干燥常常造成颗粒不可复原的团聚，尤其是在超细粉体制备方面，液相中的纳米颗粒经干燥会聚结为难以分散的团块，这主要是因为普通的颗粒干燥过程中水分在从颗粒间孔道散发，表面张力导致高的附加压力，将颗粒紧压在一起成为团块。
而冷冻干燥可以避免这一问题，冷冻干燥是先将待干燥凝胶或血液冷冻为固体，再在合理的条件先通过升华作用而使其中的水分气化而脱除水分，由于冰的气化过程不会对固体颗粒的聚结状态产生影响，因此可以完好保存原来的颗粒不被压紧而团聚，此外冷冻干燥适合处理生物制品，比如血液等，因为它没有高温操作，可以防止生物制品变质。
1、用冷冻干燥机制备样品应尽可能扩大其表面积，其中不得含有酸碱物质和挥发性有机溶剂;
2、样品冻结成冰，如有残留液体会造成气化喷射;
3、冷冻干燥机冷阱约为零下65度，可以做低温冰箱使用，但戴保温手套操作防止冻伤;
4、启动真空泵以前，检查出水阀是否拧紧，充气阀是否关闭，有机玻璃罩与橡胶圈的接触面是否清洁无污物，良好密封;
5、一般情况下，该冷冻干燥机不得连续使用超过48小时;
6、样品在冷冻过程中，温度逐渐降低，可以将样品取出回暖一段时间后，继续干燥，以缩短干燥时间。
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